პანდემიის დაწყებიდან მოყოლებული, სადიაგნოსტიკო ტესტირებამ მნიშვნელოვანი როლი ითამაშა SARS-CoV-2-ის, ვირუსის გავრცელების კონტროლში.COVID 19.ანტიგენის სწრაფი ტესტებიშესრულებული სახლში ან კლინიკურ გარემოში იძლევა შედეგებს 15 წუთში ან ნაკლებ დროში.რაც უფრო ადრე დაუსვამენ ადამიანს დიაგნოზს, მით უფრო მალე შეუძლია მიმართოს სამედიცინო დახმარებას და იზოლირება მოახდინოს სხვებისგან.მაგრამ როდესაც ვირუსის ახალი ვარიანტები გამოჩნდება, ეს ვარიანტები შესაძლოა ამ ტესტებით ვერ გამოვლინდეს.
ანტიგენის სწრაფი ტესტების უმეტესობა შექმნილია SARS-CoV-2 ნუკლეოკაფსიდური ცილის ან N-პროტეინის გამოსავლენად.ეს ცილა უხვად გვხვდება ვირუსულ ნაწილაკებში და ინფიცირებულ ადამიანებში.სწრაფი ტესტის ნაკრებიჩვეულებრივ შეიცავს ორ განსხვავებულ სადიაგნოსტიკო ანტისხეულს, რომლებიც აკავშირებენ N ცილის სხვადასხვა ნაწილს.როდესაც ანტისხეული აკავშირებს ნიმუშში N ცილას, ტესტის კომპლექტზე გამოჩნდება ფერადი ხაზი ან სხვა სიგნალი, რაც მიუთითებს ინფექციაზე.
პროტეინი N შედგება 419 ამინომჟავის სტრუქტურული ერთეულისგან.ნებისმიერი მათგანი შეიძლება შეიცვალოს სხვა ამინომჟავით მუტაციით.კვლევითი ჯგუფი, რომელსაც ხელმძღვანელობს ფ.ფილიპ ფრანკი და ერიკ ორტლუნდი ემორის უნივერსიტეტიდან დაიწყეს გამოეკვლიონ, თუ როგორ მოქმედებს ეს ერთი ამინომჟავის ცვლილება ანტიგენის სწრაფი ტესტის შესრულებაზე.მათ გამოიყენეს ტექნიკა, რომელსაც ეწოდება ღრმა მუტაციის სკანირება, რათა ერთდროულად შეეფასებინათ, თუ როგორ მოქმედებს ვირუსის N პროტეინის თითოეული მუტაცია დიაგნოსტიკური ანტისხეულების შეკავშირებაზე.მათი შედეგები გამოქვეყნდა Cell-ში 2022 წლის 15 სექტემბერს.
მკვლევარებმა შექმნეს ყოვლისმომცველი ბიბლიოთეკა თითქმის 8000 N ცილის მუტაციით.ეს ვარიანტები ყველა შესაძლო მუტაციის 99,5%-ზე მეტს შეადგენს.შემდეგ მათ შეაფასეს, თუ როგორ ურთიერთქმედებს თითოეული ვარიანტი 17 განსხვავებულ სადიაგნოსტიკო ანტისხეულთან, რომლებიც გამოიყენება 11 კომერციულად ხელმისაწვდომი სწრაფ ანტიგენის ტესტში, მათ შორის საერთოსახლის ნაკრები.
ჯგუფმა შეაფასა N-ცილის რომელი მუტაცია ახდენს გავლენას ანტისხეულების ამოცნობაზე.ამ ინფორმაციის საფუძველზე მათ შექმნეს „გაქცევის მუტაციის პროფილი“ თითოეული სადიაგნოსტიკო ანტისხეულისთვის.ეს პროფილი განსაზღვრავს სპეციფიკურ მუტაციებს N პროტეინში, რამაც შეიძლება გავლენა მოახდინოს ანტისხეულების უნარზე დაკავშირება მის სამიზნეზე.ანალიზმა აჩვენა, რომ დღევანდელ სწრაფ ტესტებში გამოყენებული ანტისხეულები აღიარებენ და აკავშირებენ SARS-CoV-2-ის ყველა წარსულსა და აწმყო ვარიანტს, რომელიც შეშფოთებას იწვევს.
მიუხედავად იმისა, რომ რამდენიმე სადიაგნოსტიკო ანტისხეული აღიარებს N ცილის ერთსა და იმავე რეგიონს, მკვლევარებმა დაადგინეს, რომ თითოეულ ანტისხეულს აქვს გაქცევის მუტაციების უნიკალური ნიშანი.ვინაიდან SARS-CoV-2 ვირუსი აგრძელებს მუტაციას და ახალი ვარიანტების გენერირებას, ეს მონაცემები შეიძლება გამოყენებულ იქნას სატესტო ნაკრების ანტისხეულების დასანიშნად, რომლებიც შეიძლება საჭირო გახდეს ხელახალი შეფასება.
„ინფიცირებული პირების ზუსტი და ეფექტური იდენტიფიკაცია რჩება კრიტიკულ სტრატეგიად COVID-19-ის შერბილებისთვის და ჩვენი კვლევა გვაწვდის ინფორმაციას მომავალ SARS-CoV-2 მუტაციების შესახებ, რამაც შეიძლება ხელი შეუშალოს აღმოჩენას“, - თქვა ორტლუნდმა.”აქ ასახული შედეგები საშუალებას გვაძლევს სწრაფად ადაპტირდეთ ამ ვირუსთან, რადგან ახალი ვარიანტები კვლავ წარმოიქმნება, რომლებიც წარმოადგენენ დაუყოვნებლივ კლინიკურ და საზოგადოებრივ ჯანმრთელობას.”
ფონი: მუტაციის ღრმა სკანირება აღმოაჩენს გაქცევის მუტაციებს SARS-CoV-2 ნუკლეოკაფსიდში ამჟამად ხელმისაწვდომი ანტიგენის სწრაფი ტესტების გამოყენებით.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA უჯრედი.2022 15 სექტემბერი;185(19):3603-3616.e13.შსს: 10.1016/ჯ.სელ.2022.08.010წ.2022 წლის 29 აგვისტო PMID: 36084631.
დაფინანსება: ბიოსამედიცინო ვიზუალიზაციისა და ბიოინჟინერიის ეროვნული ინსტიტუტი NIH (NIBIB), დიაბეტის, საჭმლის მომნელებელი და თირკმელების დაავადებათა ეროვნული ინსტიტუტი (NIDDK) და ალერგიისა და ინფექციური დაავადებების ეროვნული ინსტიტუტი (NIAID), ამერიკის გულის ასოციაცია.
NIH Research Matters არის NIH კვლევის ძირითადი შედეგების ყოველკვირეული განახლება, რომელიც განიხილება NIH ექსპერტების მიერ.მას ჯანდაცვის ეროვნული ინსტიტუტის დირექტორის კომუნიკაციებისა და საზოგადოებასთან ურთიერთობის სამსახური აქვეყნებს.